Skip to content

Воспроизведение некоторых результатов из статьи про GOATOOLS: A Python library for Gene Ontology analyses (DOI:10.1038/s41598-018-28948-z)

Notifications You must be signed in to change notification settings

Reproducibility-FBB-MSU/GOATOOLS_repr

Repository files navigation

GOATOOLS

GOATOOLS: A Python library for Gene Ontology analyses (DOI:10.1038/s41598-018-28948-z) В рамках студенческого проверка по python были/будут воспроизведены некоторые результаты, представленные в статье: -Fig. 5B, D

В репозитории присутсвует пакет скриптов goatools, так как при установке с помощью pip скачивается более старая версия goatools, в которой отсутствую некоторые полезные функции для работы с GOTerms, например get_all_upper(), с помощью которой можно найти все вышестоящие вершины графа(=найти всех родителей).

About

Воспроизведение некоторых результатов из статьи про GOATOOLS: A Python library for Gene Ontology analyses (DOI:10.1038/s41598-018-28948-z)

Resources

Stars

Watchers

Forks

Releases

No releases published

Packages

No packages published