PubMed Article Scraper

Ce script Python vous permet de rechercher des articles scientifiques sur PubMed, d'extraire leurs informations bibliographiques, de calculer la similarité cosinus entre les mots-clés et les titres des articles, et de télécharger les fichiers PDF des articles sélectionnés.

Organisation des fichiers

• Scraper_PubMed.py : Contient les fonctions pour scraper les informations bibliographiques des articles à partir de PubMed.
• Scraper_PDF.py : Contient les fonctions pour télécharger les fichiers PDF des articles.
• utils.py : Contient les fonctions de traitement de texte.
• __init__.py : Fichier d'initialisation qui importe toutes les bibliothèques nécessaires.
• main.py : Fichier principal qui exécute le programme en utilisant les fonctions des deux scrapers.

Installation

1. Assurez-vous d'avoir Python installé sur votre système. Si ce n'est pas le cas, vous pouvez le télécharger à partir du site officiel : python.org.

2. Clônez ce référentiel GitHub sur votre machine locale en utilisant la commande suivante :

   git clone https://github.com/votre_utilisateur/pubmed-article-scraper.git
   

3. Accédez au répertoire du projet :

   cd pubmed-article-scraper
   

4. Installez les dépendances requises en exécutant la commande suivante :

   pip install -r requirements.txt
   

Utilisation

1. Exécutez le script main.py en utilisant la commande suivante :

   python main.py
   

2. Suivez les instructions à l'écran pour saisir votre requête de recherche, spécifier le nombre d'articles à récupérer, choisir un article parmi les résultats et télécharger son PDF.

Fonctionnalités

• Recherche d'articles sur PubMed en utilisant des mots-clés.
• Détection automatique de la langue des requêtes de recherche.
• Extraction des informations bibliographiques des articles trouvés.
• Calcul de la similarité cosinus entre les mots-clés et les titres des articles.
• Téléchargement des fichiers PDF des articles sélectionnés.

Auteur

BERKANI Yacine