🍺🍺🍺 https://github.com/tenoto/hoppy
このパッケージは、Ｘ線データ解析でよく使う処理を自動化するためのライブラリやスクリプトの集合体です。
pyenv と pyenv-virtualenv の環境で動かせるのが理想です。
シェル設定ファイル (e.g., ~/.zshrc) に以下の
export HOPPY_PATH="Path/To/User/Hoppy/Directory"
alias hoppyinit="source $HOPPY_PATH/setenv/setenv.bashrc"
毎回、コマンドプロンプトを立ち上げるたびに、
heainit
hoppyinit
とすれば動かせるようになるはずです。Python の必要なライブラリは要求されたら、pip install xxx で随時入れてください。
(本当は python ライブラリのバージョン管理して、環境ごとダウンロードできるようにしたいのですが、時間が取れないので、とりあえず...）
Xspec の自動解析を、コマンドラインをそのまま書き下して実装。
xspec.py:
get_xspec_rate.py: Xspec のshow rateコマンドで表示されるレートを読んでくれる。xspec_fit.py: ひとつの Xspec のフィッティングを実行する。make_csv2xspec.py: 入力するスペクトルファイル、rmf, arf のレスポンスファイル、パラメータの yaml ファイルを入力したら、xspec_multi_fit.pyの入力ファイルに変換してくれる。xspec_multi_fit.py:xspec_fit.pyをシリーズで複数回実行する。
hoppy/nicer
├── cli (コマンドライン・スクリプト群)
│ ├── niwget.py
│ ├── ...
│ └── niauto.py
├── nicer.py (モジュール)
nicer.py: メインのライブラリ。NicerElfクラスは、寝ている間に仕事をしてくれる妖精さん(Elf)で、複数の ObsID のデータを扱う。NicerObsIDとNicerGTIはそれぞれ、ObsID 単位、GTI 単位でのデータを扱う。
niget_target_summary_sheet.py: NICER Team のターゲット天体と ObsID リスト(Target Summary Sheet)をダウンロードします。チームの ID と Password が必要になります。nishow_target_segment_sheet.py: Target Summary Sheet から、該当する天体もしくは ObsID の情報を抜き出して表示してくれます。niget_yyyymm.py: ObsID を指定し、該当するデータが保存されているディレクトリ（観測年と月）を教えてくれる。niwget.py: 指定した ObsID もしくは、ターゲット名のデータをすべてダウンロードしてくる。HEASARC の公式アーカイブを探し、もしなければ NICER チーム内のアーカイブを確認する。
nipipeline.py: 設定条件ファイルのレシピにしたがって、複数の ObsID についてパイプライン処理をしていきます。簡易的にスペクトル生成の結果まで作りますが、フィットは別にしてあります。niauto.py: データダウンロード、パイプライン処理、スペクトル・フィットまでを自動化してある。
timeseries.py:
tmsearchburst.py: イベント形式のデータで、一定幅の時間変動を示すライトカーブから、それに当てはまらな増大を検出する。
- Python package lesson https://github.com/BillMills/pythonPackageLesson (see demo python package)
- PEP 8 -- Style Guide for Python Code https://www.python.org/dev/peps/pep-0008/?
- 2020-08-17 modified (Teruaki Enoto)
- 2018-11-14 new version 0.1.0 is created for CLI interface using click.