Curso oferecido pelo Programa de Pós-graduação em Biologia Celular e Molecular (PPGBCM) da Universidade Federal do Rio Grande do Sul (UFRGS).
- Dr. Igor Pessi (Universidade de Helsinki, Finlândia)
- Dr. Alexandre Macedo (UFRGS)
- Dr. Jenni Hultman (Universidade de Helsinki, Finlândia)
| Período | Atividade | |
|---|---|---|
| Manhã | Palestra: Apanhado geral e informações práticas | SLIDES |
| Manhã | Palestra: Introdução ecologia microbiana | SLIDES |
| Manhã | Palestra: Introdução metagenômica | SLIDES |
| Manhã | Palestra: Introdução linha de comando | SLIDES |
| Tarde | Prática: Linha de comando | EXERCÍCIO |
| Período | Atividade |
|---|---|
| Manhã | OPCIONAL: Atendimento individual para dúvidas |
Aula adiada devido ao feriado de Finados.
Data para recuperação a ser discutida.
| Período | Atividade |
|---|---|
| Manhã | OPCIONAL: Atendimento individual para dúvidas |
| Período | Atividade | |
|---|---|---|
| Manhã | Esclarecimento de dúvidas do dia anterior | |
| Manhã | Palestra: Controle de qualidade de sequências | SLIDES |
| Manhã | Conexão ao supercomputador Puhti | |
| Manhã | Prática: Relatórios de qualidade das sequências brutas | EXERCÍCIO |
| Manhã | Discussão: Relatórios de qualidade das sequências brutas | |
| Tarde | Prática: Limpeza de sequências | EXERCÍCIO |
| Período | Atividade | |
|---|---|---|
| Manhã | Esclarecimento de dúvidas do dia anterior | |
| Manhã | Palestra: Montagem de metagenomas | SLIDES |
| Manhã | Palestra: Obtenção de perfis taxonômicos e funcionais | SLIDES |
| Manhã | Demonstração: Obtenção de perfis taxonômicos e funcionais | |
| Tarde | Prática: Montagem de metagenomas | EXERCÍCIO |
| Tarde | Prática: Análise das montagens | EXERCÍCIO |
| Período | Atividade | |
|---|---|---|
| Manhã/Tarde | Prática: Obtenção de perfis taxonômicos e funcionais | EXERCÍCIO |
| Período | Atividade | |
|---|---|---|
| Manhã | Esclarecimento de dúvidas do dia anterior | |
| Manhã | Palestra: Metagenômica a nivel de genomas | SLIDES |
| Manhã | Demonstração: Obtenção de MAGs usando anvi'o | |
| Tarde | Prática: Obtenção de MAGs usando anvi'o | EXERCÍCIO |
| Período | Atividade |
|---|---|
| Manhã | OPCIONAL: Atendimento individual para dúvidas |
| Período | Atividade | |
|---|---|---|
| Manhã | Esclarecimento de dúvidas do dia anterior | |
| Manhã | Prática: Análise de MAGs | SLIDES |
| Manhã | Prática: Exemplos para análise de MAGs | EXERCÍCIO |