JUst a SEquence toolKIt for Transcriptomics
基于 Python v3.10
和 PyQt5
开发,软件打包使用 pyinstaller
进行,请在右侧 Release 下载。
JuseKit.zip
解压后使用文件夹中的 Jusekit.exe
打开。
古早版本可以直接下载 JuseKit.exe
打开,但运行速度和性能等可能有所下降。
该软件也可直接使用源码运行,不过需要安装好已使用的包。
也可扒源码编脚本直接运行。
教程可见:Juse's blog
若存在报错 Bug 可以联系 Juse 修复。
目前已经实现的功能:
- 提取最长转录本。
- 根据 id 提取序列。
- 对序列的 id 进行各种处理。
- 串联序列并得到分区信息。
- 批量进行序列格式转换。
- 批量提取 Orthofinder 的 orthogroup 对应的 CDS 序列。
- 批量进行序列的物种数和长度过滤。
- 火山图绘制。
- 气泡图绘制。
- 组装指标计算。
目前已有的小功能:
- 学习计时器。
- 批量改后缀。