Skip to content

JUst a SEquence toolKIt for Transcriptomics, provides convenient visual interactive operations for related analysis

Notifications You must be signed in to change notification settings

JuseTiZ/JuseKit

Repository files navigation

JuseKit

JUst a SEquence toolKIt for Transcriptomics

基于 Python v3.10PyQt5 开发,软件打包使用 pyinstaller 进行,请在右侧 Release 下载。

JuseKit.zip 解压后使用文件夹中的 Jusekit.exe 打开。

古早版本可以直接下载 JuseKit.exe 打开,但运行速度和性能等可能有所下降。

该软件也可直接使用源码运行,不过需要安装好已使用的包。

也可扒源码编脚本直接运行。

教程可见:Juse's blog

若存在报错 Bug 可以联系 Juse 修复。

目前已经实现的功能:

  • 提取最长转录本。
  • 根据 id 提取序列。
  • 对序列的 id 进行各种处理。
  • 串联序列并得到分区信息。
  • 批量进行序列格式转换。
  • 批量提取 Orthofinder 的 orthogroup 对应的 CDS 序列。
  • 批量进行序列的物种数和长度过滤。
  • 火山图绘制。
  • 气泡图绘制。
  • 组装指标计算。

目前已有的小功能:

  • 学习计时器。
  • 批量改后缀。

About

JUst a SEquence toolKIt for Transcriptomics, provides convenient visual interactive operations for related analysis

Topics

Resources

Stars

Watchers

Forks

Packages

No packages published

Languages