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03_Fiches_thematiques/Fiche_donnees_spatiales.html

@@ -638,7 +638,7 @@ <h1 class="title"><span id="spatdata" class="quarto-section-identifier"><span cl
 </div>
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-<p>Le <em>package</em> <code>sf</code> est une extension du <em>package</em> <code>dplyr</code> pour les objets géographiques. On peut donc utiliser le <em>pipe</em> (<code>%&gt;%</code>) pour chaîner des opérations avec <code>sf</code>, ce qui est souvent pratique (voir la fiche <a href="https://www.book.utilitr.org/03_fiches_thematiques/fiche_tidyverse#encha%C3%AEner-les-manipulations-avec-lop%C3%A9rateur-pipe">Manipuler des données avec le tidyverse</a>).</p>
+<p>Le <em>package</em> <code>sf</code> est une extension du <em>package</em> <code>dplyr</code> pour les objets géographiques. On peut donc utiliser le <em>pipe</em> (<code>%&gt;%</code>) pour chaîner des opérations avec <code>sf</code>, ce qui est souvent pratique (voir la fiche <a href="https://book.utilitr.org/03_fiches_thematiques/fiche_tidyverse#encha%C3%AEner-les-manipulations-avec-lop%C3%A9rateur-pipe">Manipuler des données avec le tidyverse</a>).</p>
 </div>
 </div>
 <section id="créer-une-table-de-données-spatiales" class="level3" data-number="23.3.1"><h3 data-number="23.3.1" class="anchored" data-anchor-id="créer-une-table-de-données-spatiales">
@@ -974,7 +974,7 @@ <h1 class="title"><span id="spatdata" class="quarto-section-identifier"><span cl
 <span class="header-section-number">23.5</span> Où trouver des données géographiques et des <em>shapefiles</em> ?</h2>
 <p>Il s’agit du domaine où la diffusion de données par l’<em>open data</em> a permis une grande diversité des sources disponibles. Certaines données sont disponibles sous forme de <em>shapefiles</em>, d’autres avec des identifiants géographiques comme le code commune à apparier à un shapefile proposant la même variable.</p>
 <p>Les limites administratives de référence sont disponibles sur le site <a href="https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/admin-express/">Admin Express</a> de l’IGN (anciennement <code>GeoFla</code>).</p>
-<p>Le code officiel géographique (COG), qui tient à jour les entités administratives (codes communes, régions, etc.) est disponible sur <a href="https://www.insee.fr/fr/information/2560452">le site de l’Insee</a> et via l’API Métadonnées. La <a href="https://www.book.utilitr.org/03_fiches_thematiques/fiche_api">fiche API</a> indique comment accéder à des données via une API.</p>
+<p>Le code officiel géographique (COG), qui tient à jour les entités administratives (codes communes, régions, etc.) est disponible sur <a href="https://www.insee.fr/fr/information/2560452">le site de l’Insee</a> et via l’API Métadonnées. La <a href="https://book.utilitr.org/03_fiches_thematiques/fiche_api">fiche API</a> indique comment accéder à des données via une API.</p>
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03_Fiches_thematiques/Fiche_graphiques.html

@@ -620,7 +620,7 @@ <h1 class="title"><span id="ggplot2" class="quarto-section-identifier"><span cla
 <section id="a-quoi-sert-esquisse" class="level3" data-number="26.2.1"><h3 data-number="26.2.1" class="anchored" data-anchor-id="a-quoi-sert-esquisse">
 <span class="header-section-number">26.2.1</span> A quoi sert <code>esquisse</code> ?</h3>
 <p>Le <em>package</em> <code>esquisse</code> propose une interface graphique qui facilite la construction de graphiques avec <code>ggplot2</code>. L’objectif de ce <em>package</em> est de vous aider à construire rapidement un code <code>ggplot2</code> pour faire le graphique que vous voulez. En revanche, <strong>l’utilisation d’<code>esquisse</code> ne remplace pas l’écriture d’un code <code>ggplot2</code>, et cet <em>add-in</em> ne doit pas être utilisé pour réaliser et exporter un graphique sans sauvegarder le code qui le produit</strong> (sinon vous ne pourrez ni reproduire ni modifier votre graphique par la suite).</p>
-<p>Vous pouvez en apprendre davantage sur les <em>add-ins</em> dans le paragraphe de <a href="https://www.book.utilitr.org/03_fiches_thematiques/fiche_rprojects#les-addins-rstudio">présentation des <em>add-ins</em></a>.</p>
+<p>Vous pouvez en apprendre davantage sur les <em>add-ins</em> dans le paragraphe de <a href="https://book.utilitr.org/03_fiches_thematiques/fiche_rprojects#les-addins-rstudio">présentation des <em>add-ins</em></a>.</p>
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03_Fiches_thematiques/Fiche_import_fichiers_parquet.html

@@ -642,7 +642,7 @@ <h1 class="title"><span id="importparquet" class="quarto-section-identifier"><sp
 <section id="données-peu-volumineuses-écrire-un-seul-fichier-parquet" class="level3" data-number="14.3.1"><h3 data-number="14.3.1" class="anchored" data-anchor-id="données-peu-volumineuses-écrire-un-seul-fichier-parquet">
 <span class="header-section-number">14.3.1</span> Données peu volumineuses: écrire un seul fichier Parquet</h3>
 <p>Les tables Parquet sont encore loin d’être majoritaires dans les liens de téléchargement notamment face au format csv. C’est la raison pour laquelle, nous allons dans cette section dérouler <strong>le processus pour obtenir un fichier Parquet à partir d’un fichier csv.</strong></p>
-<p>Dans un premier temps, on importe le fichier plat avec la fonction <strong>fread()</strong> du <em>package</em> <strong>data.table</strong>, conformément aux recommandations de <a href="https://www.book.utilitr.org/03_fiches_thematiques/fiche_import_fichiers_plats">la fiche sur les imports de fichiers plats</a>. On obtient un objet <code>data.table</code> en mémoire. Dans un second temps, on exporte ces données en format Parquet avec la fonction <code><a href="https://arrow.apache.org/docs/r/reference/write_parquet.html">write_parquet()</a></code> du <em>package</em> <code>arrow</code>.</p>
+<p>Dans un premier temps, on importe le fichier plat avec la fonction <strong>fread()</strong> du <em>package</em> <strong>data.table</strong>, conformément aux recommandations de <a href="https://book.utilitr.org/03_fiches_thematiques/fiche_import_fichiers_plats">la fiche sur les imports de fichiers plats</a>. On obtient un objet <code>data.table</code> en mémoire. Dans un second temps, on exporte ces données en format Parquet avec la fonction <code><a href="https://arrow.apache.org/docs/r/reference/write_parquet.html">write_parquet()</a></code> du <em>package</em> <code>arrow</code>.</p>
 <div class="cell">
 <div class="sourceCode" id="cb1"><pre class="downlit sourceCode r code-with-copy"><code class="sourceCode R"><span><span class="kw"><a href="https://rdrr.io/r/base/library.html">library</a></span><span class="op">(</span><span class="va"><a href="https://r-datatable.com">data.table</a></span><span class="op">)</span></span>
 <span><span class="kw"><a href="https://rdrr.io/r/base/library.html">library</a></span><span class="op">(</span><span class="va"><a href="https://magrittr.tidyverse.org">magrittr</a></span><span class="op">)</span></span>
@@ -821,7 +821,7 @@ <h1 class="title"><span id="importparquet" class="quarto-section-identifier"><sp
 </div>
 </div>
 <!-- ## Exploiter un fichier Parquet avec le _package_ `duckdb` -->
-<!-- Dans le cas de fichiers volumineux, il est également possible de les requêter avec le langage `SQL` grâce au _package_ [`duckdb`](https://duckdb.org/docs/api/r.html). Cette méthode est basée sur le moteur portable `DuckDB` qui permet à n'importe quel ordinateur d'accéder à des performances d'un moteur de base de données classique qui utilise un serveur. Pour plus d'informations sur la façon d'exécuter des requêtes sur des bases de données, consultez [cette fiche](https://www.book.utilitr.org/03_fiches_thematiques/fiche_connexion_bdd#ex%C3%A9cuter-des-requ%C3%AAtes). En fonction des cas d'usage, la méthode présentée ici peut être encore plus efficace que celle avec `arrow` et `dplyr`, mais elle implique de savoir exprimer les requêtes en langage SQL. -->
+<!-- Dans le cas de fichiers volumineux, il est également possible de les requêter avec le langage `SQL` grâce au _package_ [`duckdb`](https://duckdb.org/docs/api/r.html). Cette méthode est basée sur le moteur portable `DuckDB` qui permet à n'importe quel ordinateur d'accéder à des performances d'un moteur de base de données classique qui utilise un serveur. Pour plus d'informations sur la façon d'exécuter des requêtes sur des bases de données, consultez [cette fiche](https://book.utilitr.org/03_fiches_thematiques/fiche_connexion_bdd#ex%C3%A9cuter-des-requ%C3%AAtes). En fonction des cas d'usage, la méthode présentée ici peut être encore plus efficace que celle avec `arrow` et `dplyr`, mais elle implique de savoir exprimer les requêtes en langage SQL. -->
 <!-- L'approche avec `duckdb` comprend trois étapes similaires à celle de l'approche avec `arrow` et `dplyr`:  -->
 <!-- - On crée une connexion au moteur `DuckDB` avec la fonction `DBI::dbConnect()`; cela nécessite de charger les _package_ `DBI` et `duckdb`; -->
 <!-- - On définit une requête avec le langage SQL; -->

03_Fiches_thematiques/Fiche_rmarkdown.html

@@ -634,7 +634,7 @@ <h1 class="title"><span id="rmarkdown" class="quarto-section-identifier"><span c
 <ul>
 <li>Des rapports ou articles en <code>pdf</code>, <code>html</code>, <code>doc</code>, <code>odt</code>, etc. ;</li>
 <li>Des présentations sous forme de slides <code>pdf</code> ou <code>html</code> ;</li>
-<li>Des sites <em>web</em> (comme celui associé à <a href="https://www.book.utilitr.org">cet ouvrage</a> ou comme <a href="https://www.utilitr.org">la page d’accueil d’utilitR</a>).</li>
+<li>Des sites <em>web</em> (comme celui associé à <a href="https://book.utilitr.org">cet ouvrage</a> ou comme <a href="https://www.utilitr.org">la page d’accueil d’utilitR</a>).</li>
 </ul>
 <div class="callout callout-style-default callout-note callout-titled">
 <div class="callout-header d-flex align-content-center">
@@ -782,7 +782,7 @@ <h1 class="title"><span id="rmarkdown" class="quarto-section-identifier"><span c
 <div class="sourceCode" id="cb3"><pre class="sourceCode yaml code-with-copy"><code class="sourceCode yaml"><span id="cb3-1"><a href="#cb3-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="pp">--- </span></span>
 <span id="cb3-2"><a href="#cb3-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="fu">title </span><span class="kw">:</span><span class="at"> </span><span class="st">"Produire des documents avec R Markdown"</span></span>
 <span id="cb3-3"><a href="#cb3-3" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="fu">author </span><span class="kw">:</span><span class="at"> </span><span class="st">"Daffy Duck"</span></span>
-<span id="cb3-4"><a href="#cb3-4" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="fu">date </span><span class="kw">:</span><span class="at"> </span><span class="st">"2024-04-09"</span></span>
+<span id="cb3-4"><a href="#cb3-4" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="fu">date </span><span class="kw">:</span><span class="at"> </span><span class="st">"2024-04-10"</span></span>
 <span id="cb3-5"><a href="#cb3-5" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="fu">output </span><span class="kw">:</span><span class="at"> </span></span>
 <span id="cb3-6"><a href="#cb3-6" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="at">  </span><span class="fu">html_document </span><span class="kw">:</span></span>
 <span id="cb3-7"><a href="#cb3-7" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="at">    </span><span class="fu">keep_md </span><span class="kw">:</span><span class="at"> </span><span class="ch">true</span></span>

03_Fiches_thematiques/Fiche_rmarkdown_param_report.html

@@ -607,7 +607,7 @@ <h1 class="title"><span id="rapports-auto" class="quarto-section-identifier"><sp
 <p>Le code source d’un rapport automatisé commence toujours par un en-tête <code>YAML</code> qui doit contenir au minimum un titre et un format de sortie. Voici un exemple d’en-tête :</p>
 <pre><code>---
 title: "Titre du rapport"
-date: '09 April 2024'
+date: '10 April 2024'
 output: pdf_document
 author: "Anne Onyme"
 description: "Une description vraiment utile"

03_Fiches_thematiques/Fiche_targets.html

@@ -717,12 +717,12 @@ <h1 class="title"><span id="targets" class="quarto-section-identifier"><span cla
 
 ℹ Use `spec()` to retrieve the full column specification for this data.
 ℹ Specify the column types or set `show_col_types = FALSE` to quiet this message.
-● completed target raw_filosofi_epci [0.185 seconds]
+● completed target raw_filosofi_epci [0.186 seconds]
 ▶ dispatched target grandes_villes
-● completed target grandes_villes [0.081 seconds]
+● completed target grandes_villes [0.085 seconds]
 ▶ dispatched target prop_sup_25k
 ● completed target prop_sup_25k [0.003 seconds]
-▶ completed pipeline [0.625 seconds]</code></pre>
+▶ completed pipeline [0.634 seconds]</code></pre>
 </div>
 </div>
 <p>Lorsque la chaîne de traitement est de taille relativement modeste (comme ici), on peut la visualiser avec la fonction <code>tar_visnetwork</code>:</p>
@@ -794,7 +794,7 @@ <h1 class="title"><span id="targets" class="quarto-section-identifier"><span cla
 ● completed target grandes_villes [0.007 seconds]
 ▶ dispatched target prop_sup_25k
 ● completed target prop_sup_25k [0.003 seconds]
-▶ completed pipeline [0.223 seconds]
+▶ completed pipeline [0.23 seconds]
 Warning message:
 In dir.create("data") : 'data' already exists</code></pre>
 </div>
@@ -874,7 +874,7 @@ <h1 class="title"><span id="targets" class="quarto-section-identifier"><span cla
 </div>
 </div>
 <div class="callout-body-container callout-body">
-<p>L’utilisation du <em>garbage collector</em> peut parfois s’avérer utile pour nettoyer la mémoire de la session <code>R</code> dans laquelle tourne le <em>pipeline</em>. Ceci est particulièrement utile lorsque les objets manipulés sont volumineux (voir la fiche <a href="https://www.book.utilitr.org/01_r_insee/fiche_utiliser_ressources">Superviser sa session R</a>).</p>
+<p>L’utilisation du <em>garbage collector</em> peut parfois s’avérer utile pour nettoyer la mémoire de la session <code>R</code> dans laquelle tourne le <em>pipeline</em>. Ceci est particulièrement utile lorsque les objets manipulés sont volumineux (voir la fiche <a href="https://book.utilitr.org/01_r_insee/fiche_utiliser_ressources">Superviser sa session R</a>).</p>
 <p>Dans <code>targets</code>, cette opération est possible en ajoutant l’argument <code>garbage_collection = TRUE</code> à la définition de la cible :</p>
 <div class="cell">
 <div class="sourceCode" id="cb15"><pre class="downlit sourceCode r code-with-copy"><code class="sourceCode R"><span><span class="fu"><a href="https://docs.ropensci.org/targets/reference/tar_target.html">tar_target</a></span><span class="op">(</span></span>