Croissance d'un foraminifère en présence d’acidification et d’augmentation de la température

Doo et al. (2020) ont étudié les effets d'une acidification et d'une augmentation de la température sur le foraminifère vertèbre Marginopora vertebralis Quoy & Gaimard 1830. Ils ont également étudié en parallèle ces effets lorsque M. vertebralis est en présence de l'un de ses hôtes, l'algue rouge Laurencia intricata J.V.Lamouroux 1813.

Les auteurs ont publié les données de cette étude (Doo et al. 2021). Vous utiliserez une partie de ces données pour appliquer l'analyse de variance à un facteur et le test de Kruskal-Wallis. Les données originales se trouvent dans le dossier data/raw, mais vous utiliserez les données remaniées growth.rds qui se trouvent dans le dossier data.

Objectifs

Ce projet est individuel et cadré. Il permet de démontrer que vous avez acquis les compétences suivantes :

• représenter graphiquement de la manière la plus appropriée les données à étudier avec une ANOVA
• formuler les hypothèses de l'ANOVA à un facteur
• réaliser une ANOVA à un facteur et l'interpréter sur des données biologiques

Consignes

Complétez le document vertebralis_notebook.qmd.

N'oubliez pas d'effectuer un “Rendu” du document en HTML à la fin de votre travail pour vérifier que tout fonctionne bien, et corrigez les erreurs éventuelles rencontrées à ce stade (très important !) Vous avez une batterie de tests à votre disposition pour des vérifications plus poussées de vos résultats (onglet "Construire" -> bouton "Construire tout"). Vérifiez également que votre dernier commit a bien été pushé sur GitHub avant la deadline.

Références

Doo, Steve S., Aero Leplastrier, Alexia Graba-Landry, Januar Harianto, Ross A. Coleman, et Maria Byrne. 2020. « Amelioration of ocean acidification and warming effects through physiological buffering of a macroalgae ». Ecology and Evolution 10 (15): 8465‑75. https://doi.org/10.1002/ece3.6552.

Doo, Steve S., Aero Leplastrier, Alexia Graba-Landry, Januar Harianto, Ross Coleman, et Maria Byrne. 2021. « Data from: Amelioration of ocean acidification and warming effects through physiological buffering of a macroalgae ». Dryad. https://doi.org/10.5061/dryad.qv9s4mwbw.