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It compares the efficiency of the BLAST algorithm in NCBI and UniProt for protein sequences of three different sizes: Na + channel, dopamine and insulin

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And-Sepulveda/comparacao_de_tempo_de_BLAST_entre_NCBI_e_Uniprot

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comparacao_de_tempo_de_BLAST_entre_NCBI_e_Uniprot

Foras usadas três sequências de proteínas: insulina (acesso AAA59172), dopamina (acesso 4ZEL_B) e canal de sódio (acesso AAA59899). As sequências foram comparadas pelo algoritmo BLAST do NCBI e do Uniprot. Os parâmetros foram: número máximo de sequências 100, tabela BLOSUM-62, valor esperado E-10 (parâmetros "default"). Os dados foram analisado por linguagem Matlab, mas pode ser usado em Octave.

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It compares the efficiency of the BLAST algorithm in NCBI and UniProt for protein sequences of three different sizes: Na + channel, dopamine and insulin

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