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traitecoevo · Aug 6, 2017 · dfe0140 · dfe0140
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diff --git a/DESCRIPTION b/DESCRIPTION
@@ -1,6 +1,6 @@
 Package: taxonlookup
 Title: A dynamically-updating versioned taxonomic resource for vascular plants
-Version: 1.1.3
+Version: 1.1.4
 Date: 2016-01-29
 Description: This is a taxon lookup table for land plants. It is built from a
     set of scripts that dynamically build a versioned genus-family-order-higher taxa

diff --git a/plant_lookup.csv b/plant_lookup.csv
@@ -16282,7 +16282,6 @@ number.of.accepted.species,number.of.accepted.and.unresolved.species,genus,famil
 1,1,Megacorax,Onagraceae,Onagraceae,Myrtales,Angiosperms
 3,5,Megapterium,Onagraceae,Onagraceae,Myrtales,Angiosperms
 0,8,Meriolix,Onagraceae,Onagraceae,Myrtales,Angiosperms
-4,4,Myrinia,Onagraceae,Onagraceae,Myrtales,Angiosperms
 1,1,Neoholmgrenia,Onagraceae,Onagraceae,Myrtales,Angiosperms
 148,468,Oenothera,Onagraceae,Onagraceae,Myrtales,Angiosperms
 2,14,Onagra,Onagraceae,Onagraceae,Myrtales,Angiosperms

diff --git a/source_data/badGeneraFamilyPairs.csv b/source_data/badGeneraFamilyPairs.csv
@@ -1 +1 @@
-genus,familyAsteriscium,CompositaeBenthamia,BoraginaceaeBrodiaea,AmaryllidaceaeBridgesia,CactaceaeBrodiaea,AmaryllidaceaeBulbostylis,CompositaeHeeria,MelastomataceaeHolboellia,BerberidaceaeHumboldtia,OrchidaceaeIsoloma,LindsaeaceaeLaxmannia,CompositaeLepidostemon,ConvolvulaceaeMyrmecophila,PolypodiaceaeOreocallis,EricaceaeParsonsia,LythraceaePseudogaltonia,LiliaceaeSchmidtia,CompositaeSwartzia,SolanaceaeThomandersia,SchlegeliaceaeWashingtonia,ApiaceaeMalacocarpus,CactaceaeLimnobium,AmblystegiaceaePleuridium,ArchidiaceaeGrimaldia,AytoniaceaeBurnettia,BrachytheciaceaePancovia,BrachytheciaceaeLamprophyllum,BryaceaeZieria,BryaceaeSolmsia,DicranaceaeCynodon,DitrichaceaeSwartzia,DitrichaceaeLeersia,EncalyptaceaeCuspidaria,EntodontaceaeMicromitrium,EphemeraceaePolypodiopsis,FissidentaceaeCorynotheca,FunariaceaeMicrostegium,FunariaceaeHarrisonia,HedwigiaceaeHarveya,HookeriaceaeHypopterygium,HookeriaceaeCtenium,HypnaceaeMassularia,JungermanniaceaeCladocolea,LejeuneaceaeLasia,LeptodontaceaeHygrophila,MarchantiaceaeMastigophora,LepicoleaceaeCoelidium,MeteoriaceaeTricholepis,MeteoriaceaeMnium,CalypogeiaceaeDistichia,NeckeraceaeCraspedophyllum,OrthotrichaceaeOxymitra,AnnonaceaeBlyttia,PallaviciniaceaeAsteriscium,PottiaceaeMollia,PottiaceaePachyneurum,PottiaceaeEsenbeckia,PterobryaceaeBrachypodium,PtychomitriaceaeAcanthocladium,SematophyllaceaeRauia,ThuidiaceaeAcanthodium,AcanthaceaeAcosta,CompositaeAdelia,OleaceaeAlliaria,MeliaceaeAnacampseros,CrassulaceaeArthraxon,LoranthaceaeBalbisia,CompositaeBartonia,LoasaceaeBassia,SapotaceaeBenthamia,CornaceaeBlechum,BlechnaceaeBrachyloma,GesneriaceaeBrocchia,SimmondsiaceaeBrugmansia,RafflesiaceaeBruguiera,CombretaceaeBrya,ChrysobalanaceaeCalophyllum,CalophyllaceaeCedrus,MeliaceaeCondalia,RubiaceaeCrepidophyllum,HymenophyllaceaeCyrtanthus,RubiaceaeDarcya,SolanaceaeDianthera,CleomaceaeDitrichum,CompositaeDonax,PoaceaeDrummondia,SaxifragaceaeDryopteris,PteridaceaeDunalia,AraceaeDusenia,CompositaeDuvalia,LeguminosaeEria,EricaceaeErucaria,PoaceaeEustegia,MelastomataceaeFilicula,WoodsiaceaeFlemingia,RubiaceaeFroelichia,RubiaceaeGastrochilus,ZingiberaceaeGerardia,AcanthaceaeGertrudia,FlacourtiaceaeGymnotheca,MarattiaceaeHaemanthus,AsparagaceaeHedwigia,BurseraceaeHelicophyllum,AraceaeHeliohebe,ScrophulariaceaeHepatica,ConocephalaceaeHeteroneurum,LomariopsidaceaeHonckenya,MalvaceaeHornschuchia,SapotaceaeHutchinsonia,CompositaeHymenolepis,PolypodiaceaeJoannesia,CompositaeJonesia,LeguminosaeLeptopyrum,PoaceaeLichtensteinia,LoranthaceaeLightfootia,BixaceaeLophiocarpus,AlismataceaeLopholepis,PolypodiaceaeLumnitzera,LamiaceaeMammea,ClusiaceaeManettia,ScrophulariaceaeMannia,SimaroubaceaeMeeboldia,CapparaceaeMertensia,GleicheniaceaeMeyenia,AcanthaceaeMeyenia,CactaceaeMicranthus,AcanthaceaeMyzorrhiza,ScrophulariaceaeNeesia,CompositaeNivenia,ProteaceaeOdontitella,ScrophulariaceaeOnychium,OrchidaceaePachypodium,BrassicaceaePanzeria,LamiaceaeParmentiera,SolanaceaePiquetia,AizoaceaePlatyloma,PteridaceaePleuridium,PolypodiaceaeRazoumofskya,LoranthaceaeReinwardtia,ConvolvulaceaeRhacoma,CompositaeRichardia,CompositaeRichea,EricaceaeRoemeria,PoaceaeRoscoea,LamiaceaeRoylea,PoaceaeSchrebera,CelastraceaeSebastiania,CompositaeSilvia,LauraceaeSolena,RubiaceaeSolenopsis,SolanaceaeSpiranthera,ConvolvulaceaeSpirostachys,AmaranthaceaeStipularia,RanunculaceaeThomandersia,ThomandersiaceaeTillandsia,AsparagaceaeTrichocyclus,AizoaceaeUncaria,PedaliaceaeUrtica,MoraceaeUsteria,EuphorbiaceaeWahlenbergia,CompositaeWaitzia,IridaceaeWebera,RubiaceaeWedelia,NyctaginaceaeWelwitschia,PolemoniaceaeWettsteinia,CompositaeWiborgia,CompositaeWilhelmsia,PoaceaeZiziphus,CannabaceaePetagnia,ApiaceaeGilibertia,AraliaceaeBonapartea,AsparagaceaePhalangium,AsparagaceaePhalangium,IridaceaePhalangium,XanthorrhoeaceaeKaulfussia,CompositaeMyconia,CompositaeOmalanthus,CompositaeBanalia,AmaranthaceaeAcetosella,PolygonaceaeRhynchocarpa,CucurbitaceaeCandollea,DilleniaceaeRostellaria,SapotaceaeRhynchocarpa,LeguminosaeCynoctonum,ApocynaceaeGoeppertia,GentianaceaeCynoctonum,LoganiaceaeGriffithia,RubiaceaeRostellaria,AcanthaceaeMyconia,GesneriaceaeZappania,LamiaceaeMoniera,PlantaginaceaeZappania,VerbenaceaeGoeppertia,LauraceaeGriffithia,AnnonaceaeAtomostigma,ChrysobalanaceaeCycnia,ChrysobalanaceaeBanalia,EuphorbiaceaeOmalanthus,EuphorbiaceaeGuidonia,FlacourtiaceaeTulasnea,PodostemaceaeGuidonia,SalicaceaeTulasnea,MelastomataceaeAcetosella,OxalidaceaeBonapartea,BromeliaceaeAtomostigma,RosaceaeCycnia,RosaceaeGilibertia,MeliaceaeMoniera,RutaceaePetagnia,SolanaceaeKaulfussia,MarattiaceaeCandollea,PolypodiaceaeTalbotia,AcanthaceaeAmblytropis,LeguminosaeAdelanthus,IcacinaceaeSchroeterella,Zygophyllaceae
+genus,familyAsteriscium,CompositaeBenthamia,BoraginaceaeBrodiaea,AmaryllidaceaeBridgesia,CactaceaeBrodiaea,AmaryllidaceaeBulbostylis,CompositaeHeeria,MelastomataceaeHolboellia,BerberidaceaeHumboldtia,OrchidaceaeIsoloma,LindsaeaceaeLaxmannia,CompositaeLepidostemon,ConvolvulaceaeMyrmecophila,PolypodiaceaeOreocallis,EricaceaeParsonsia,LythraceaePseudogaltonia,LiliaceaeSchmidtia,CompositaeSwartzia,SolanaceaeThomandersia,SchlegeliaceaeWashingtonia,ApiaceaeMalacocarpus,CactaceaeLimnobium,AmblystegiaceaePleuridium,ArchidiaceaeGrimaldia,AytoniaceaeBurnettia,BrachytheciaceaePancovia,BrachytheciaceaeLamprophyllum,BryaceaeZieria,BryaceaeSolmsia,DicranaceaeCynodon,DitrichaceaeSwartzia,DitrichaceaeLeersia,EncalyptaceaeCuspidaria,EntodontaceaeMicromitrium,EphemeraceaePolypodiopsis,FissidentaceaeCorynotheca,FunariaceaeMicrostegium,FunariaceaeHarrisonia,HedwigiaceaeHarveya,HookeriaceaeHypopterygium,HookeriaceaeCtenium,HypnaceaeMassularia,JungermanniaceaeCladocolea,LejeuneaceaeLasia,LeptodontaceaeHygrophila,MarchantiaceaeMastigophora,LepicoleaceaeCoelidium,MeteoriaceaeTricholepis,MeteoriaceaeMnium,CalypogeiaceaeDistichia,NeckeraceaeCraspedophyllum,OrthotrichaceaeOxymitra,AnnonaceaeBlyttia,PallaviciniaceaeAsteriscium,PottiaceaeMollia,PottiaceaePachyneurum,PottiaceaeEsenbeckia,PterobryaceaeBrachypodium,PtychomitriaceaeAcanthocladium,SematophyllaceaeRauia,ThuidiaceaeAcanthodium,AcanthaceaeAcosta,CompositaeAdelia,OleaceaeAlliaria,MeliaceaeAnacampseros,CrassulaceaeArthraxon,LoranthaceaeBalbisia,CompositaeBartonia,LoasaceaeBassia,SapotaceaeBenthamia,CornaceaeBlechum,BlechnaceaeBrachyloma,GesneriaceaeBrocchia,SimmondsiaceaeBrugmansia,RafflesiaceaeBruguiera,CombretaceaeBrya,ChrysobalanaceaeCalophyllum,CalophyllaceaeCedrus,MeliaceaeCondalia,RubiaceaeCrepidophyllum,HymenophyllaceaeCyrtanthus,RubiaceaeDarcya,SolanaceaeDianthera,CleomaceaeDitrichum,CompositaeDonax,PoaceaeDrummondia,SaxifragaceaeDryopteris,PteridaceaeDunalia,AraceaeDusenia,CompositaeDuvalia,LeguminosaeEria,EricaceaeErucaria,PoaceaeEustegia,MelastomataceaeFilicula,WoodsiaceaeFlemingia,RubiaceaeFroelichia,RubiaceaeGastrochilus,ZingiberaceaeGerardia,AcanthaceaeGertrudia,FlacourtiaceaeGymnotheca,MarattiaceaeHaemanthus,AsparagaceaeHedwigia,BurseraceaeHelicophyllum,AraceaeHeliohebe,ScrophulariaceaeHepatica,ConocephalaceaeHeteroneurum,LomariopsidaceaeHonckenya,MalvaceaeHornschuchia,SapotaceaeHutchinsonia,CompositaeHymenolepis,PolypodiaceaeJoannesia,CompositaeJonesia,LeguminosaeLeptopyrum,PoaceaeLichtensteinia,LoranthaceaeLightfootia,BixaceaeLophiocarpus,AlismataceaeLopholepis,PolypodiaceaeLumnitzera,LamiaceaeMammea,ClusiaceaeManettia,ScrophulariaceaeMannia,SimaroubaceaeMeeboldia,CapparaceaeMertensia,GleicheniaceaeMeyenia,AcanthaceaeMeyenia,CactaceaeMicranthus,AcanthaceaeMyzorrhiza,ScrophulariaceaeNeesia,CompositaeNivenia,ProteaceaeOdontitella,ScrophulariaceaeOnychium,OrchidaceaePachypodium,BrassicaceaePanzeria,LamiaceaeParmentiera,SolanaceaePiquetia,AizoaceaePlatyloma,PteridaceaePleuridium,PolypodiaceaeRazoumofskya,LoranthaceaeReinwardtia,ConvolvulaceaeRhacoma,CompositaeRichardia,CompositaeRichea,EricaceaeRoemeria,PoaceaeRoscoea,LamiaceaeRoylea,PoaceaeSchrebera,CelastraceaeSebastiania,CompositaeSilvia,LauraceaeSolena,RubiaceaeSolenopsis,SolanaceaeSpiranthera,ConvolvulaceaeSpirostachys,AmaranthaceaeStipularia,RanunculaceaeThomandersia,ThomandersiaceaeTillandsia,AsparagaceaeTrichocyclus,AizoaceaeUncaria,PedaliaceaeUrtica,MoraceaeUsteria,EuphorbiaceaeWahlenbergia,CompositaeWaitzia,IridaceaeWebera,RubiaceaeWedelia,NyctaginaceaeWelwitschia,PolemoniaceaeWettsteinia,CompositaeWiborgia,CompositaeWilhelmsia,PoaceaeZiziphus,CannabaceaePetagnia,ApiaceaeGilibertia,AraliaceaeBonapartea,AsparagaceaePhalangium,AsparagaceaePhalangium,IridaceaePhalangium,XanthorrhoeaceaeKaulfussia,CompositaeMyconia,CompositaeOmalanthus,CompositaeBanalia,AmaranthaceaeAcetosella,PolygonaceaeRhynchocarpa,CucurbitaceaeCandollea,DilleniaceaeRostellaria,SapotaceaeRhynchocarpa,LeguminosaeCynoctonum,ApocynaceaeGoeppertia,GentianaceaeCynoctonum,LoganiaceaeGriffithia,RubiaceaeRostellaria,AcanthaceaeMyconia,GesneriaceaeZappania,LamiaceaeMoniera,PlantaginaceaeZappania,VerbenaceaeGoeppertia,LauraceaeGriffithia,AnnonaceaeAtomostigma,ChrysobalanaceaeCycnia,ChrysobalanaceaeBanalia,EuphorbiaceaeOmalanthus,EuphorbiaceaeGuidonia,FlacourtiaceaeTulasnea,PodostemaceaeGuidonia,SalicaceaeTulasnea,MelastomataceaeAcetosella,OxalidaceaeBonapartea,BromeliaceaeAtomostigma,RosaceaeCycnia,RosaceaeGilibertia,MeliaceaeMoniera,RutaceaePetagnia,SolanaceaeKaulfussia,MarattiaceaeCandollea,PolypodiaceaeTalbotia,AcanthaceaeAmblytropis,LeguminosaeAdelanthus,IcacinaceaeSchroeterella,ZygophyllaceaeMyrinia,Onagraceae