Sisältää nimensä mukaisesti latex koodin ja tietenkin lopullisen pdf tiedoston.
Sisältää lyhyitä scriptejä esim kuvaajia varten ja muutaman esimerkin. Jotkin tiedostot toimivat vain unix ja unix-like koneilla koska parallel paketti toimii vaan niillä.
Sisältää R paketin, jota on käytetty R koodin apuna. Sisältää c++ koodia joten tarvitsee kääntäjän. Kääntäjänä on käytetty gcc:tä. ~/.R/Makevars tiedostossa minulla on
CC=gcc-9
CXX=g++-9
CXX11=g++-9
CFLAGS=-mtune=native -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion
CXXFLAGS=-mtune=native -g -O2 -Wall -pedantic -Wconversion
FLIBS=-L/usr/local/Cellar/gcc/9.2.0_3/lib/gcc/9
joilla paketti ainakin kääntyy. Tämä pakottaa R:n käyttämään gcc:tä sillä MacOS:ssä default asetuksilla gcc on symlink Apple clang kääntäjään eikä oikeaan gcc:n historiallisista syistä, ja openmp ei oikein toimi yhteen Applen kääntäjän kanssa. Gcc minulla on perus homebrew gcc. Kääntö tapahtuu
cd ~/path/to/directory/
R CMD build && R CMD install [tarball name]
Tai asennus suoraan tarballista
cd ~/path/to/directory/
R CMD install [tarball name]
helperfunctions::sampleGibbs funktio aiheuttaa segfaultin. Teinkin tämän lopulta R:llä. En suosittele ajamaan siis tuota functiota
Sisälttää esimerkki 1:n laskettuna APL:llä huvin vuoksi