Relation Extraction using BERT and BioBERT - using BERT, we achieved new state of the art results
Nous tenons à remercier Mme. Solen Quinou et M. Samuel Chaffron qui ont encadré ce projet.
Ce fichier contient les liens des notebooks colab afin de pouvoir tester le code.
Il faut assurer une connexion au google drive et mettre les données fourni dans le repertoire drive sous le chemin suivant:
/biobert_re/{corpus}
où corpus designe les 2 repertoires "GAD" et "euadr"
/biobert_re/GAD/* /biobert_re/euadr/*
Lien vers les données:
https://github.com/hushee69/biobert-relation-extraction
Lien vers les google colab:
GAD modèle : https://colab.research.google.com/drive/1XNyKyu3e8WrOW5w0rNqXxZOoKV3LBoZ5?usp=sharing euadr modèle : https://colab.research.google.com/drive/14D49imRXzBLdQJKRsAdahgWpDtCu7hzw?usp=sharing
D'ailleurs, si vous disposez d'un GPU, alors il suffit de télécharger le notebook et de créer les repertoires comme décrit ci-dessus