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paugier/plot-covid19-fr

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Plot covid-19 France

Ce dépot contient du code permettant de visualiser les données en rapport avec l'épidémie de COVID-19 en France. On se concentre pour l'instant sur la reprise de l'épidémie quelques mois après la sortie du confinement (à partir d'août 2020, donc).

Comment visualiser les figures?

  • Pour visualiser les figures sans le code (avec Voilà), c'est par là-bas http://tiny.cc/plot-covid19-fr

  • Pour visualiser les figures sans le code (avec Voilà et Binder), cliquez sur ce bouton : Binder Voila

  • Pour visualiser le code et les figures et potentiellement modifier le code (avec Jupyter Notebook), cliquez sur ce bouton : Binder

  • Il y a aussi une instance sur Heroku gratuit (https://plot-covid19-fr.herokuapp.com/) mais ça rame dès que plusieurs utilisateurs sont connectés!

  • Pour l'instant le plus efficace est encore de récupérer le code et de lancer l'application localement (voir plus bas).

A propos des données utilisées

Données Système d’Informations de DEPistage (SI-DEP)

https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-relatives-aux-resultats-des-tests-virologiques-covid-19/

Données hospitalières

https://www.data.gouv.fr/fr/datasets/donnees-hospitalieres-relatives-a-lepidemie-de-covid-19/

Thanks

Le projet est hébergé sur foss.heptapod.net. Merci à Octobus et Clever Cloud!

Lancer l'application localement (plus rapide)

L'application tourne sur Python 3.8. Pour récupérer les sources, le plus simple est de cloner le dépot avec Mercurial avec la commande hg clone https://foss.heptapod.net/graphics/plot-covid19-fr. Pour mettre à jour, il faudra juste faire depuis le répertoire du dépôt hg pull -u. Pour les utilisateurs de Git qui ne voudraient pas découvrir le zen de Mercurial, utiliser le dépôt miroir https://github.com/paugier/plot-covid19-fr.

Ensuite pour installer et lancer :

cd plot-covid19-fr
python3.8 -m pip install -r requirements.txt
voila plot_covid19.ipynb

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