start codon position problem

[linzhi2013]

这个应该跟参考数据库里面的蛋白基因本身的注释存在问题有关。应该是由于数据库里面的这个基因，由于他们上传的注释结果就是在目前mitoz给出的注释结果的后面（如果该基因在正链的话），导致mitoz将参考蛋白与老师您的序列比对时候，也只能比对到这个位置。

mitoz 会自动往前找起始密码子，找到第一个之后，就停止了。

老师的想法是，只要能够往前延伸，就把坐标不断往前推？即使最终预测到的基因长度很长？

因为参考数据库里边的长度也未必对

如果参考数据库本身有问题呢

只是我认为细菌 线粒体什么的 不会平白无故多出来一些非编码区域

你也考虑一下吧 其实这东西最好有转录组能验证
但我的延长规律也是我一己之见。