Incomplete RNAMES?

[weishwu]

I ran Sniffles2 with --output-rnames to report read names for each SV so that I can focus on them in the downstream analysis. One of the insertions is:

RP23-157J4-ZsGreen	81814	Sniffles2.INS.6ES0	N	CACCGCAGGGTTGAACGCGTCTAATAACAACTCAAGGCAAACATTTGCTTGAGCCACTACTGCAAAATTAAGAAATCATATAAACAAAATTTCAATGTAAAATATCACAGGGGAAGCATTTCCAATCTGAAAGGAAGAAGGGGGTGGTAGAAAGGATGGATGGAACTAAGAAAAACTGAAATGGTGCTAGTTAAACACTAGGTGCTCTTGCTGCATGTCCGGCATTAAGGAAGTGTAGATGAAATTGTCCTCTAAGATATTAGACAAGTCTGCCTTTGCAGCTCTACTGACACAGGGTCTCTCCTAGGTTGACTGTACTTTTTGTATTTGGCATTAACTAGCAGATTTCCAGGATCCTGACTTTGTTATCTCTTGGAATGTTTACCACAGTCTGATTGCATGCTTTCAGGTTTTTGTATTGCTCTTTTAGTGACTGCAAACATGACTCTGCCATAGTTTGGCATAACAACAACGCCCTTCCTTTGAATCTGGGTAGAATTCTCTTTGATGACACAACTCATGGTTTCAGTGTTTCTGTGAAGCAAAAAATAAAGGATGGAACTGTGCAGCAGCTCACCTCTGTGGACTATGCTTGACACTGGCCAAGTGCCTGATGAGGGAGAAACTGCTATAGTAAAGCCTTTCATATTATTTAAAACCGTGAGAATACATGAGCCTATGATGAGCAGAGCCTGGTAAATTTCTTATATTCTTTCAAAGTCTCTTTATTATTGTACCAATTCAAAGCATGTAGCTTTTTTTTAAACCTGCTAATCTCTTTAGTAGCCCTATCTTTCTTAGACCCAGATTTAAATGCACTTTTCCTGGACAAATTGCAAGTTTTTTTTCAAATCTTTCTGTTCTTCTAATCCTTCAATATAAATTGGATAAAAACAGCTAGCAAAAACTGTACAGCACCCAGCATGTTCAGTTGCTGTTGAGCAATGTTTGAGCAATGGCACCCTACTTTATTGAATTACTTGGAGGCTATGAAGACACTGAGAAGTGGAGCACAGATGTCAGAAGAAGATCACTAGAAAAAGAGCTTTGAATGTTCTGCCTCTGAATCGAGTCTAGCTCTCTACTTCCTGATTCATTAAGAAGTGAGACTGCCATATCCGGAGACCCATCCCATAATCAGCTTCCAAACGCGGACACCATTGCATACACTAGCAAGATTTTGCTGAAAGGACCCAGATATAGCTGTCTTTTGTGAGACTATGCCGGGGCCTAGCAAACACAGAAGTGGATGCTCACAGTCAGCTATTGGATGGATCACAGGGCCCTCAATGGAGGAGCTGGAGGAAGTACCCAGGGAGTTGGGGGATCTACAACCCTATACGTGGAACAACAATATGAACTAACCAGTACCCCCAGCCCCCTGAACTCGTGTCTCTAGCTACATATGAATCACAAGATGGCCTAGTCAGCCATCAGTTGAAAAGAGAGGCCCATTGGTTGTGCAAACTTTATATGACTCAGTACAGGGGAACGCCAGGGCCAAGAAGTGGGAGTGAGTGGGTGGGGAAGTAGGTGGGGGGAGTGTGTGGGGGACTTTTGGGATAGCATCTGGAAATGTAAATGAAATAAATACCCCCCCCAAAAAAAAAGAAGTGAGGATGATCGGCTACAAGGTTCTGATGCCAGGAACTCTACCATATCATCTCTGGTATGATGGAAATTATGCCCCAAAGTTAAAGCCAAAATAAACCCTTCTTCCTTTAAGTTGCTTTTGCTTAGTACAAAAGAGGAATTATGCCTACCACATTACCAGAAAAATGTTGCAAACAAACAAACGTGGAAAGCTTTCATTTCAAAACAGAATTATAAAGCTTCCTTGCTTGCATATGGTGCAAGGCCTGGCCATACCTTAAAATGGGGTAGAACTTAGTGTTACATTGGTCTGGTTCTGCAAGCCTGTAAACTACAAGAATGTCAGGGCTGAGGAGGCTTGAACAAATCCTCCAAAGAAAAGCCTCTGAAGCCATGAAACCATAGTGTGGATACTTTGGTCCATCTTAGAAGGTGGGACAAAATACCCATGGGAGGTGATACAGAGACAAAGTGTGGAGCAGAGACTGAAGGAAAGACCATCCAGAGTTTTGCCCCACTTGGATATCCAACCCATATACAGTCATCAAATCCAGACACTATTGTGGATGCCAACAAGTGCTGACAGGAGCTTGATATAGCTATCTCCTGAGAGGTGCTGCCAGTGCCTGACAAATACACAGGTGGATGATCTCAGCCAACCATTGGACTGAGCATGGGGTCCCTAATGGAGGAGCTAGAGAAAGACCCAAGTAGCTGAAGGGGTTTGCAGCCCCATTGGAGGAACAATTTTAACCAACCAGTAACTTCAGAGTTCCCAGGGACTAAACAACCAAAGATTACACATGGAGGGAACCATGGTCCCAGCCGCATATGTAGCAAAGGATAGACTTGTTGGTTATCAGTGGGATGACAGACCTAGCATTTCCCTACACTGGGGCATCAAGCCTTGTGCTTAGTCCAGTACAGAGCATCCACTTTTGTATTTGTCATGCACTCATGAGAGTGTCTCAAGTAGCTATAACAGGCTTCTGTTAGCAAGTTCTTGTTGGCGTCCACAATAGTGTCTGGGTTTGGTGATTGTTTATGGGATAGATACCCAGGTGGGGCAGTCTTTCGGGAGTAGTCTTTTCCTTCAGTTGATTCTCTGCTCCAGACTAACTCCTCCATGAGTAATTCATAATCCCTTCTAAGAAGGACTGAAATATCCATACTTTGGTTCTTCCTCCTTACTGACTTTCATGTGATTTATGAATTGTATCTTGGGTATTCCAAGCTTCTGGGCTAATATCCACTTATCAATGAGTGCATACCATGTGTGTTCTTTTGTGATTGGGTTACCTTACTTATGATGATATTTTCTAGTTCCATCCATTTGCCTAAGAATTTCAGGAATTCATTGTTTTTAATAGCTGAGTAGTACTTCATTGTGTAAATGTACCACATTTTCTGTATCCATTCCTTTGTTGAGGGACAGCACACAGAATCTTTCTGCTCCCTGCAGATCCAGATGTAAAACTCTCAGTTACTTCTCAACAACATGTCCACCTGCATACCACCATCCTTTCTGCCTCTATGATGGTGGATTAAGTCATTGAAACTATGAGCAAGTCACAGTTAAATGCTTCTTTTGATAAGTGTTGCCGTGGTCATGTTTTCTGTTCACAGCAACAGAAAATTTACTAAGACATTCCTGGCCAACCTTTTTCTATTTCCTGCTTCAGGGTGACTTAAGAAGTTTCTACCACATGCTCTTGTTGCCATGAATTATCTATTTTTTACCACTGCAATGGGATATACTGTGCATTGATGTCATACAGGTGAGGGCAGGTGAAATATAAGTCTAGACCCTGTGATTGGGCAATGGAAAAAGAAGGTGGGGCTGAAAGTTTCAGAGAGAAGACAAAGATAGACAAAAGAGAGAAGATGAAAGAAGAAGTACCTGATCCACATGGCTTGAAAGAGTCTCAGGTAGCTCTGAATATCTTAGAAGGACAATAGAGTTATGTAGGGTACATTTGTCCCATATAGGTGTGCAGCTTGTGTTTATATCAATTGAGTTTTCAGTTCTTTGTGTGGGTATTTTAGGGGTTGAGGATATACTGTTATAAATCTCGCTGAGAAATTATAAACGTCTGGAGTTTATAGCCAGCAGCTGTCAGTATCAGCAGGCTAGCCACAGGGGAAGGATGGATTGAGAAATACAACTGGTGTGCAGTGGCAGGGTAACCTTGGGAACCTGGGACTTGCAGCTCCTAATGGGGGAGATGAGACCACATTATGAGTACAAAGACGGCATTAGCATAGATTTTAAAAAAAATATCGCACACAACACTATACACTATGAACCAATTATCTGAAATATGTTCCCTCCTATTTTTTCCTTTCAAATGTTTTAGTACAGTAAGGAAAATGCCATTAATACAATTGCCTTGAAATTTTCCAGCAGATTAATTATTTCATGACAAATACATACTCAAGAACAGGGCATAAACAAAATATAGACAACCTTTTAGCAGAAAAGTAATACAAATGACTGTAGTCCAACTCCTAGCAGAATGCTTCTTTTCATTTGAACCCTTAGAAGGTGGTCTTTACTCTCTGAGTTCCTCACTAGCAAACTCCTCTTCTGAGCACCTGCCAAAGACTTCCATTAAGCTCTGCCTAGGACACTTCACTAAATTCCCAAATTCCTCTCATGATCACTTGCAGTGGCCCTGACTCATGTGCCCAGATACAGTAAAAAGCTAGCTTTCATAGTAGACTTCTATATTTGTCAATTATCATCATGGTGGTACAATACCTGTGGGGAAAAAATAAAGGATAGAAATTTGGGACTCACGATTTCCAACATTGAAATCATGGCTCTCTGACTATGGAAAGAGGAAATCCCATGATGGAAAAGCATCATGACCGAGAGCTGTTCACCTCTTGGAAGCCAGAAAGCAGAAATCCAGAGAAAAGAAAGATCAGGGGACAAGATCTACTTTTCAAAGACAAATCCCAAGAACATCATTCCTGAGGATAAAGCCCATCTCCCAATAGCCCATTCAGTAACAAACTTGCCAGTGGAGTAATCTATTCAGGAGTTCTTTCATAACACCACAATGACCCGTCAGCATGACACTAGTCAGAGACCAAGTCTTCAAATATTAGCCTGGGGGACATGGACCATTTATCCAAACAATATATATATATATCCAAACAATATATATATATATATATATATATATATACATATATATATATATATATGTATATATATATATATATATATATATATGTTTCAGAAAAAATTTCACTCACTTATGAAGATATTATCAATGAATGTTCCATGGTTGAGAATGTAATTTAGTAAGTGGTAAATTAATAGAACAAAAATGTAAGGCAATACATTTAATAC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DV is 95, so I would expect ~95 read names, but there is only one in RNAMES. How can I find the others?