/
example_data_2_geno_positions.txt
75504 lines (75504 loc) · 649 KB
/
example_data_2_geno_positions.txt
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
9795
11231
11244
11799
12150
12934
13288
14370
16749
17094
17408
19079
20892
22347
23254
24962
28655
30416
31570
33116
35416
38984
39088
39227
39346
39508
39707
40366
40527
40891
43093
44931
45122
46930
48272
48505
48699
49362
49905
50181
50799
51517
56187
56328
57272
57377
69976
72302
72412
72998
73121
73538
74529
74600
74614
74678
74760
75194
75720
75952
76713
77013
77063
77613
77635
77864
79495
79657
80775
81158
81900
82017
82476
82539
82643
82844
82931
83488
83897
84025
84374
84568
84721
85310
85454
85900
85933
86004
86125
86148
86460
86555
87154
87173
87362
87409
87419
87456
87576
87745
87841
88086
88171
88280
88505
88695
91723
91918
92382
92551
92899
93413
93853
94951
94995
95685
96084
97407
97975
99330
101267
109736
110683
112083
112436
113802
113832
114163
114188
115900
116020
116241
116466
116728
117701
117995
118589
118642
118814
118940
119189
119822
119839
121928
126856
128188
129967
130013
131222
133844
133926
134405
136030
136107
136318
137520
139797
139809
140069
141321
142282
143171
145162
145675
145804
148142
152242
154402
155903
157404
157851
158061
158306
158634
161423
161523
164811
165074
165281
166783
167011
167662
168262
168290
168303
168757
169018
169308
169537
169853
169942
170262
170632
170730
170836
172128
173058
174153
174444
175967
176355
176577
178177
178983
180107
180580
181623
181858
182373
184168
184238
184419
184802
184828
184992
185497
185545
185618
186020
186507
186530
186540
186737
187294
187664
187688
187697
188704
188706
189131
189234
189366
189396
191147
191306
191352
191398
192092
192933
194018
194392
195647
196064
196926
197240
198076
198934
199494
200721
203240
203882
204107
204727
204886
204992
205032
205320
206865
207156
208980
212997
213968
215842
215946
217006
217690
217703
218775
222333
225832
226806
227774
231535
231877
232814
232834
233323
234047
234526
234838
236233
236776
236922
236996
237362
237612
237785
238257
238318
238763
239751
239971
244172
251936
252086
252550
256189
256935
257692
258269
258474
258493
259290
261237
263842
270612
271308
271583
273102
274016
274150
274478
276959
277842
281463
281497
282403
283225
283621
284570
285386
288235
289868
289946
292079
292631
292885
293617
293864
294751
295202
295355
295382
295459
295558
295908
296166
296188
296334
297306
297737
298490
299015
299070
299634
299664
299725
299944
300036
300170
300507
300717
301008
301085
301110
301709
304785
305050
306935
308460
308610
308789
312747
313598
313607
316905
317428
318150
319819
320358
321836
324465
325226
325979
326242
328980
329191
330876
331720
332898
333052
335727
337456
337881
339170
339564
345928
346278
348883
350171
350440
350921
351653
351661
352407
352916
352947
354058
354559
354734
354876
355059
355108
356253
356651
357802
359242
359773
359842
362133
363205
363487
364149
364956
366199
366267
366334
367067
368098
369511
370031
370348
372198
372852
373097
373434
373606
373865
374057
374349
374433
379502
379732
383258
388443
391798
391896
394852
401461
401919
404249
404452
404473
404717
407403
407720
407820
409819
410008
411995
415358
416001
420727
421592
421902
424285
427319
428851
430114
432038
433180
433321
436065
436433
437009
440830
441174
441205
441243
441507
441609
442654
443739
443744
444342
450620
450937
451119
451654
453492
459897
460067
462459
463927
465161
465857
465887
466752
467697
468471
473493
474670
475495
475967
478458
478812
478966
479074
479174
479221
479978
480059
480103
480332
480925
483497
484429
484536
484785
484859
485678
486203
486247
486829
487018
487123
487650
487833
489262
489335
489589
490382
490700
491301
491616
491744
492015
492363
492417
493600
493905
495749
495972
496187
497364
497598
497907
497918
498600
498788
498815
498818
499921
501233
501269
501928
502791
502965
503352
504094
504783
509125
509189
509916
510314
512373
512893
513308
513985
520872
521036
522308
527657
529248
531104
531587
532863
534955
535162
536089
539694
539769
539820
540038
540470
540525
540801
541308
541318
541488
541620
541641
541661
542780
543579
545738
546195
546278
546427
546536
546694
548847
548964
549035
550622
550878
551024
551620
552435
553889
553937
554714
557367
558661
559929
565808
567392
567611
569825
573267
574081
574164
574289
574502
575307
576890
578970
579117
579425
580959
582349
583054
586921
589893
591677
591919
593853
596989
600097
606378
607286
607441
607483
608793
609269
613551
615979
616361
616559
616646
616663
617301
617942
618581
618749
619575
619591
620567
621424
621542
621640
621709
621748
622962
623322
623903
624442
624762
626578
626767
628165
629164
630306
631616
635772
639592
639821
640275
642061
642894
643060
643670
646987
649011
649631
650570
650921
652353
652452
652699
654759
654793
655880
657689
657972
661177
661430
661786
662462
662547
662613
663175
664233
665428
665522
665569
665649
665818
665920
666703
667383
667740
667854
668604
669928
671060
671155
672578
673460
677990
678289
679211
679474
679744
679927
681838
681963
681994
682646
683538
683858
685032
685052
685859
687206
687308
687452
687518
688833
688919
689847
690252
690631
690716
690831
690931
691018
691220
691272
691770
691827
692032
692050
692308
692382
692415
692450
692570
692847
693444
693898
693963
694098
694885
694952
695835
696974
698204
698738
700132
700368
700633
700876
701310
701363
701487
701516
701739
701917
702367
702381
702511
702685
703027
703171
703253
704074
704519
704531
704982
705498
706982
707315
708863
711195
711968
714594
715720
720614
721989
729645
729740
729848
730046
730070
730706
730798
731382
731864
732346
732898
732958
733087
733108
735341
736665
737390
738119
738296
739208
739745
739957
742435
743716
746755
750123
751752
754471
754878
755635
755864
756383
757589
757822
757837
757930
758707
759975
760009
761751
762151
762368
762381
762701
766075
767030
767662
768203
768962
771504
772422
774513
774666
778152
778298
779093
779882
780763
781686
782107
782152
782251
782324
782480
784236
784346
784485
784526
784700
784811
785076
785800
785874
786001
786260
786290
787038
787070
787313
787515
787568
787588
788337
788405
788783
789096
790329
790938
791659
791733
791843
791889
791945
792007
792672
792723
792801
794983
795183
795279
795355
795420
796617
796897
797169
797249
797253
797388
797435
797993
798420
798519
798583
799618
799769
799791
800847
801435
801502
802134
802251
802681
802754
802807
802940
803339
804837
805132
805271
805377
806325
806841
807147
807467
807606
808802
809639
810823
811508
811706
812512
812640
812660
812997
813107
813366
814230
814350
814365
814742
814943
818556
819236
819830
820123
820175
820466
820509
820602
821277
821600
821749
823159
823368
823913
824243
824578
824702
825205
828964
829703
830598
830803
831000
831034
831156
831382
831514
831644
832070
832132
832841
834002
834050
834546
834853
834856
835040
835521
835675
835800
836523
837317
837349
837722
837869
838278
838349
839062
839510
840438
840948
842125
842722
842951
842967
843038
843169
843325
843457