/
example_data_1_geno_positions.txt
39497 lines (39497 loc) · 347 KB
/
example_data_1_geno_positions.txt
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
14431347
14432618
14433624
14433659
14433758
14434713
14434960
14435070
14435171
14435207
14439734
14441016
14441342
14449374
14452292
14480059
14482325
14483902
14492336
14516814
14520628
14553179
14607431
14611423
14632600
14647521
14724414
14724572
14725582
14725954
14726071
14727194
14731852
14744825
14745495
14787120
14853585
14869239
14874095
14874187
14874473
14874682
14884399
14967208
14999031
15009152
15010874
15013820
15024918
15029282
15042015
15231640
15235274
15235303
15235618
15235788
15238253
15238287
15238684
15238968
15242245
15243070
15245262
15250393
15251440
15257135
15258039
15258423
15268577
15268900
15270125
15270296
15270307
15270816
15273449
15274090
15274264
15276164
15276210
15276762
15276882
15280134
15282425
15285893
15291574
15291828
15295998
15298335
15298847
15298867
15318376
15332978
15333120
15343545
15346809
15348466
15350900
15353226
15363606
15369290
15370420
15370526
15410792
15412698
15429825
15429907
15430088
15434027
15434720
15436022
15437138
15437597
15443359
15445079
15446732
15447504
15448748
15450109
15451043
15452483
15453066
15455353
15460378
15464609
15464762
15467656
15467705
15469639
15470474
15474749
15476707
15476864
15477416
15479107
15480497
15480911
15481987
15482604
15483078
15483717
15485666
15486294
15487266
15487330
15488619
15489150
15492280
15492342
15496233
15501886
15503478
15510409
15516658
15520023
15529033
15529300
15532611
15534984
15534992
15535383
15544372
15544478
15544773
15549522
15551377
15553913
15555288
15557075
15557470
15557794
15557906
15558015
15558213
15558230
15558332
15558586
15560510
15563103
15567276
15567577
15567689
15567719
15568058
15569132
15569194
15569718
15570111
15570730
15572143
15575268
15575679
15575867
15576300
15578998
15580597
15582602
15583103
15586030
15586496
15590318
15591075
15591341
15591440
15591973
15592113
15592553
15592992
15593298
15594252
15594669
15595732
15596894
15597201
15599250
15599356
15599625
15600001
15601495
15601812
15605174
15605193
15605319
15605407
15605715
15605903
15605950
15607403
15607461
15607600
15608796
15609968
15611133
15611512
15611603
15611719
15614497
15618270
15618335
15618906
15621459
15623464
15624600
15624734
15625309
15625340
15634399
15635296
15635527
15635752
15636231
15637198
15637295
15638201
15638313
15638797
15638808
15639954
15640536
15641026
15642699
15643854
15644565
15644904
15645124
15645194
15646361
15646625
15646949
15647006
15647459
15648016
15648152
15649076
15650265
15651714
15651842
15652246
15653178
15653468
15653728
15654435
15655394
15658762
15660345
15660822
15661392
15661931
15662549
15663820
15664065
15664540
15665049
15665949
15666147
15666329
15666712
15668200
15668220
15668377
15668988
15669118
15670010
15670674
15671543
15673143
15674251
15674997
15675703
15675764
15676235
15676426
15676700
15676720
15680320
15681217
15681843
15683383
15683469
15684132
15684246
15684887
15685777
15686104
15686184
15687742
15688241
15689296
15689362
15689517
15689555
15689881
15690488
15690741
15691027
15692596
15693288
15693872
15694151
15694977
15695102
15695458
15695503
15695621
15696313
15696555
15697062
15697100
15697233
15697346
15698150
15698333
15698367
15698682
15699156
15700361
15701768
15703243
15703853
15704383
15704504
15705148
15706181
15706432
15706550
15706668
15706914
15707157
15707181
15707595
15707712
15708627
15709355
15709601
15710409
15711020
15711656
15712664
15712915
15714052
15718134
15718286
15718446
15719003
15719129
15720077
15720419
15720639
15720798
15720906
15721904
15722240
15722480
15723037
15725122
15726384
15726544
15727348
15727460
15732097
15733947
15751336
15752135
15767645
15769912
15773020
15773239
15773451
15773876
15774989
15775434
15775610
15775724
15775974
15776459
15776465
15776612
15776613
15776966
15777875
15778508
15778800
15778812
15779211
15779588
15781834
15782322
15782459
15783936
15784911
15785173
15785330
15787349
15787566
15788116
15788859
15789897
15789957
15790128
15790373
15790790
15791899
15792168
15792216
15792806
15793554
15793595
15794103
15794162
15794640
15794892
15795490
15795572
15795956
15796219
15797742
15801989
15806401
15807037
15807664
15808080
15808123
15808815
15808982
15809384
15809434
15809893
15810040
15810931
15812482
15813210
15813221
15813888
15814084
15814253
15814521
15814924
15815034
15816627
15816762
15816846
15817310
15817483
15817681
15818737
15818982
15820953
15821449
15821524
15822154
15822206
15822223
15822739
15822987
15823131
15823179
15823238
15823263
15823381
15825502
15825710
15826157
15826825
15826914
15826991
15828143
15828404
15829115
15830515
15830538
15831185
15831710
15831854
15831966
15832925
15832966
15834695
15834945
15835391
15842185
15846249
15846491
15846783
15846918
15847073
15847411
15847474
15847684
15847823
15849026
15849310
15849558
15850779
15851354
15851369
15852032
15852071
15852239
15854812
15855014
15855191
15855654
15855921
15856064
15868195
15868430
15868669
15868727
15869300
15869546
15869577
15869890
15870932
15871584
15872203
15872452
15872533
15873293
15873431
15873520
15873708
15873720
15873792
15874101
15874547
15875145
15879890
15880036
15880417
15881980
15882191
15884047
15884945
15893703
15897298
15899579
15900850
15902807
15904190
15904203
15904569
15904728
15905525
15905584
15905610
15905970
15906055
15906489
15906532
15907063
15907495
15907847
15909500
15909583
15909814
15911732
15913056
15913396
15914726
15915124
15915220
15915520
15916016
15916145
15916181
15916470
15916555
15917530
15917830
15918439
15918719
15918808
15918860
15918980
15919129
15919544
15919625
15919678
15921673
15921858
15922650
15923048
15923482
15924834
15925859
15928971
15929526
15933198
15934915
15937144
15937308
15941513
15941913
15944907
15945013
15945035
15945932
15946206
15947699
15947807
15951355
15951604
15955800
15960394
15960813
15961838
15962776
15965441
15965808
15966471
15967680
15967975
15968305
15969209
15969246
15969297
15969567
15970744
15971089
15971823
15973685
15974886
15974915
15975070
15975746
15976178
15976229
15976388
15977297
15977462
15977768
15978409
15979170
15979844
15980977
15982839
15983801
15984471
15985824
15987894
15989825
15989839
15991515
15992750
15992815
15994011
15995213
15995234
15995372
15996151
15996217
15996510
15998142
15998164
15999076
15999292
15999716
16000130
16001704
16002267
16003408
16004072
16006665
16010486
16010647
16011893
16012202
16013669
16013785
16014050
16015858
16021079
16023546
16023725
16023843
16024131
16027862
16029774
16032219
16033955
16035388
16035898
16036724
16038006
16038341
16040556
16040646
16041178
16041347
16041508
16041791
16042163
16042917
16043117
16043240
16045413
16046437
16049151
16049306
16050224
16050256
16050807
16051042
16051133
16054099
16054117
16055045
16055324
16055900
16056102
16056590
16057699
16059549
16060519
16061849
16062165
16062294
16065194
16068402
16070409
16070430
16071795
16074473
16075703
16076027
16077781
16077861
16078080
16078173
16080284
16081234
16082778
16083572
16085622
16085808
16089828
16090860
16092611
16093378
16094695
16095771
16098119
16098606
16098911
16101551
16101595
16102024
16102442
16102536
16102885
16104049
16104093
16104167
16104663
16104829
16104936
16105764
16106469
16107125
16108832
16109044
16111977
16113896
16115191
16115654
16116410
16118100
16122368
16122515
16123228
16123426
16124553
16126101
16126528
16127195
16129096
16130525
16131168
16138677
16139549
16140350
16141425
16142536
16142736
16143180
16144482
16145505
16146115
16146437
16146937
16148221
16148417
16148521
16149065
16149317
16149687
16150181
16151164
16161035
16161555
16162012
16162813
16163945
16164602
16165224
16168722
16169010
16170349
16170593
16170731
16171564
16172740
16173012
16173206
16173969
16175408
16176971
16177775
16178800
16178848
16179368
16179387
16179529
16179956
16180472
16180757
16183593
16183786
16184207
16190483
16190876
16192160
16193139
16194148
16194811
16196836
16197967
16198146
16203261
16205432
16207558
16207617
16207684
16207976
16208072
16209612
16209955
16210042
16210125
16210244
16210578
16211441
16211813
16212142
16214655
16214898
16218682
16218809
16220160
16220410
16221198
16222731
16224295
16226171
16230784
16231683
16232805
16233714
16236960
16238763
16238855
16240048
16240253
16240634
16240685
16241131
16241458
16241476
16241659
16242147
16242268
16246198
16246989
16247492
16247549
16248536
16249334
16255554
16255564
16260070
16260143
16263220
16265697
16266806
16267147
16267534
16268609
16268621
16268812
16268891
16270073
16270558
16270752
16271053
16271078
16271234
16271554
16272371
16272618
16273850
16274083
16274158
16274901
16275051
16275551
16276206
16276534
16277544
16277608
16278098
16278402
16278858
16279113
16279136
16279175
16279209
16279518
16279634
16279841
16281683
16282056
16283330
16283550
16283914
16283917
16284558
16284866
16284931
16284959
16285148
16285346
16285851
16286513
16288162
16288285
16289524
16289998
16290586
16290638
16290844
16292086
16292139
16292220
16292423
16292796
16292894
16293785
16293989
16294004
16295330
16295430