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File metadata and controls

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gtz-3.0.1 [2021/04/06]

1、提升大文件的压缩性能

2、修复了一些兼容性问题

gtz-3.0.0 [2020/12/15]

1、支持三代基因数据的高倍率压缩(PacBio/Nanopore)

2、修复了已知问题

gtz-2.1.4 [2020/07/02]

重要修复:

存在一些特定场景,gtz压缩包解压成fastq.gz格式时,有可能需要解压多次才能成功,但解压成fastq格式时却没有问题

gtz-2.1.3 [2020/03/16]

优化了一些特性

gtz-2.1.2 [2019/11/13]

修复gtz在遇到以下两种情况时,会报压缩失败然后退出的问题:

1、遇到非常特殊的fastq.gz格式文件

2、遇到具有非常特殊CPU型号的服务器

gtz-2.1.1 [2019/09/16]

1、修复一个已知的问题

gtz-2.1.0 [2019/08/21]

1、支持bam压缩

2、压缩fastq.gz文件时,性能较原来提升了一倍以上

3、修复之前版本反馈有些fasta处理不了的问题

4、将fastq格式的gtz解压成gz格式时,可以通过-l/--level可以修改gz格式的压缩级别

gtz-2.0.1 [2019/05/23]

1、修复了一个在极特殊情况下,gtz解压不正常问题

gtz-2.0.0 [2019/05/08]

1、不再需要制作bin,直接使用--ref指定物种fasta(速度很快)

2、默认情况下,加压使用参考基因组后,解压不再需要,除非使用了--donot-pack-ref

3、增加了速度和压缩级的参数(-l 0~9)

gtz-1.2.3 [2019/01/24]

主要修改如下:

1、提高了压缩gz文件和解压成gz文件的性能

2、解决gtz不能运行在某些特定CPU型号的服务器上的问题

3、修正压缩gz格式文件时进度条显示超过100%的问题

4、新增 -s 参数,用于压缩时开启物种自动识别功能,该参数在-b指定了bin文件时会失效

5、新增 --bin-path 参数,用于开启物种自动识别时,指定bin文件所在目录。如果没有修改bin默认路径(~/.config/gtz),则可以不指定

gtz-1.2.2 [2018/11/09]

主要优化索引文件的加载速度,压缩速度会有明显的提升

gtz-1.2.1 [2018/10/30]

1、解决压缩完成后做校验时,gtz有时会比较慢的问题

2、解决用-c做解压时,-e不工作的问题

gtz-1.2 [2018/10/25]

1、解决GTZ有时加载慢的问题

2、解决输入ctrl+c,gtz有时不能退出的问题

gtz-1.1 [2018/10/16]

增加功能:

1、-c/--stdout 解压到终端

2、-z/--fastq-to-fastq-gz 将fastq解压成gz格式,该选项只对fastq有效,非fastq会忽略该选项

gtz-1.0 [2018/10/11]

基础修订